Proses produksi film Borderlands menghadapi sejumlah kendala signifikan, terutama akibat pandemi COVID-19 yang melanda dunia pada 2021. Sutradara Eli Roth mengungkapkan bahwa pembatasan protokol kesehatan saat itu menciptakan situasi yang jauh lebih rumit daripada yang diperkirakan oleh tim produksi. Dalam wawancara terbaru di podcast The Town, Roth mengakui bahwa tidak ada pihak yang benar-benar siap menghadapi dampak pandemi terhadap industri perfilman.

Berikut beberapa tantangan utama yang dihadapi selama produksi: - Pembatasan interaksi fisik menghambat proses pra-produksi, termasuk latihan dengan pemeran pengganti dan pra-visualisasi adegan. - Lokasi syuting yang tersebar akibat kebijakan pembukaan kota secara bertahap, membuat koordinasi tim menjadi sangat sulit. - Keterbatasan komunikasi karena anggota kru terpaksa bekerja secara terpisah di berbagai lokasi.

Roth mengakui bahwa produksi film besar dengan skala seperti Borderlands menjadi pengalaman yang merendahkan hati bagi seluruh tim. "Kami semua berpikir bisa mengatasinya, tetapi kenyataannya jauh lebih kompleks," ujarnya. Situasi semakin rumit ketika Roth harus beralih ke proyek lain, Thanksgiving, pada 2023, sehingga Tim Miller (Deadpool) mengambil alih proses syuting ulang Borderlands.

Perubahan kreatif juga terjadi selama proses produksi. Naskah awal yang ditulis Craig Mazin pada 2020 mengalami beberapa revisi, termasuk penulisan ulang oleh Zak Olkewicz. Syuting ulang pada 2023 tidak hanya mencakup adegan-adegan baru tetapi juga penyesuaian alur cerita berdasarkan revisi naskah tersebut.